机械神教高层对万机之神信仰十分坚定又拥有机械思维，对于欧米茄并没有多少的尊敬。
更何况五大星域事实上分解了庞大的人类帝国，各大科学院的强势崛起在这六七百年的时间内快速削弱了机械神教的地位。
除了太阳星域，机械神教在四大星域已经失去了技术垄断地位。
从人类帝国的生态位来看，帝国科学院与机械神教的生态位是重叠的相互竞争的关系，技术是帝国必要之物。
大远征时期的机械神教靠着帝皇与奥林匹斯协议不断壮大，帝国疆域越大机械神教组织也越大，帝国数百万颗人类星球都需要技术实现社会进步。
过去的机械神教垄断了机械技术，可以说机械神教的势力遍及帝国数百万颗人类星球。
势力庞大更进一步压制了帝国其他科研机构的崛起，最终机械神教实现了技术的绝对垄断；以宗教的名义强行消灭打压任何的科学机构，以消灭异端的名义消灭大量的科学家与技术人员。
机械神教的教义认为任何的机械技术都属于万机之神，因此学习任何机械技术都要经过机械神教的允许。
又由于机械神教的宗教性质与极度保守的态度，庞大的机械神教事实上造成了人类帝国的技术封锁，任何的科学进步都极度艰难，反而时间越久技术越退步。
欧米茄正是意识到了机械神教的技术垄断与封锁，才搞出一个三大侧理念以扶持帝国真理的名义扶持科学侧。
一万年来机械神教满银河挖掘了无数黑暗时代的技术却固步自封，很多高端的技术都只在教内高层流动，中下层的机械技术一万年维持不变。
机械神教不仅造成了技术垄断，还占据了人类帝国的技术生态位压制了所有的科学研究。
帝国科学院的崛起就打破了机械神教的绝对垄断地位，一万年来很多科技创新都是科学院创造的。
人们在学习机械技术之时除了机械神教多了另一个选择。
万年后的现在，基里曼效仿阿尔法科学院建立了极限科学院，欧米茄在风暴星域与太平星域全力扶持科学院。
无尽战争的庞大需求造就了科学院的快速崛起，五大星域的科学院势力急速成长占据了机械神教过去的生态位，过去机械神教干的事情全由科学院接手了。
被占据生态位的机械神教，自然无法像大远征时期一样随着帝国疆域的扩大和对战争的需求变得越来越强。
机械神教不仅势力还有影响力都被大幅度削弱，机械神教高层自然把这种不满放到欧米茄的身上，因此机械神教高层从铸造将军到贤者并不尊敬欧米茄。